Protein–RNA interactions for Protein: Q96JL9

ZNF333, Zinc finger protein 333, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF333Q96JL9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF333Q96JL9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF333Q96JL9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF333Q96JL9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF333Q96JL9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF333Q96JL9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF333Q96JL9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF333Q96JL9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF333Q96JL9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF333Q96JL9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF333Q96JL9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF333Q96JL9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF333Q96JL9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF333Q96JL9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF333Q96JL9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF333Q96JL9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF333Q96JL9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF333Q96JL9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF333Q96JL9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF333Q96JL9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF333Q96JL9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF333Q96JL9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF333Q96JL9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF333Q96JL9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF333Q96JL9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF333Q96JL9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF333Q96JL9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF333Q96JL9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF333Q96JL9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF333Q96JL9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF333Q96JL9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF333Q96JL9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF333Q96JL9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF333Q96JL9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF333Q96JL9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF333Q96JL9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF333Q96JL9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF333Q96JL9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF333Q96JL9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF333Q96JL9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF333Q96JL9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF333Q96JL9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF333Q96JL9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF333Q96JL9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF333Q96JL9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF333Q96JL9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF333Q96JL9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms