Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRIG1Q96JA1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LRIG1Q96JA1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms