Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN37Q96GY3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN37Q96GY3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms