Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC35A4Q96G79 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35A4Q96G79 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.2 ms