Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTERF3Q96E29 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTERF3Q96E29 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTERF3Q96E29 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms