Protein–RNA interactions for Protein: Q969E4

TCEAL3, Transcription elongation factor A protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL3Q969E4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCEAL3Q969E4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCEAL3Q969E4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEAL3Q969E4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEAL3Q969E4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEAL3Q969E4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEAL3Q969E4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEAL3Q969E4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCEAL3Q969E4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TCEAL3Q969E4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCEAL3Q969E4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCEAL3Q969E4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCEAL3Q969E4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCEAL3Q969E4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCEAL3Q969E4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCEAL3Q969E4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEAL3Q969E4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEAL3Q969E4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEAL3Q969E4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEAL3Q969E4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEAL3Q969E4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEAL3Q969E4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEAL3Q969E4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEAL3Q969E4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEAL3Q969E4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCEAL3Q969E4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEAL3Q969E4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms