Protein–RNA interactions for Protein: Q92901

RPL3L, 60S ribosomal protein L3-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3LQ92901 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL3LQ92901 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL3LQ92901 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms