Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM3CQ92520 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM3CQ92520 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FAM3CQ92520 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM3CQ92520 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM3CQ92520 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM3CQ92520 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM3CQ92520 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM3CQ92520 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM3CQ92520 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM3CQ92520 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM3CQ92520 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM3CQ92520 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM3CQ92520 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM3CQ92520 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM3CQ92520 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM3CQ92520 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM3CQ92520 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM3CQ92520 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM3CQ92520 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM3CQ92520 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM3CQ92520 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM3CQ92520 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM3CQ92520 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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