Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB3IL1Q8TBN0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3IL1Q8TBN0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms