Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEN9

PDZD8, PDZ domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD8Q8NEN9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PDZD8Q8NEN9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZD8Q8NEN9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZD8Q8NEN9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDZD8Q8NEN9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
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