Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM87AQ8NBN3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM87AQ8NBN3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM87AQ8NBN3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM87AQ8NBN3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM87AQ8NBN3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM87AQ8NBN3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM87AQ8NBN3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM87AQ8NBN3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM87AQ8NBN3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM87AQ8NBN3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM87AQ8NBN3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM87AQ8NBN3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM87AQ8NBN3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM87AQ8NBN3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM87AQ8NBN3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM87AQ8NBN3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM87AQ8NBN3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM87AQ8NBN3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM87AQ8NBN3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM87AQ8NBN3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM87AQ8NBN3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM87AQ8NBN3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM87AQ8NBN3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM87AQ8NBN3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM87AQ8NBN3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM87AQ8NBN3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM87AQ8NBN3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM87AQ8NBN3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM87AQ8NBN3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM87AQ8NBN3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM87AQ8NBN3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM87AQ8NBN3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM87AQ8NBN3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM87AQ8NBN3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMEM87AQ8NBN3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMEM87AQ8NBN3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM87AQ8NBN3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM87AQ8NBN3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM87AQ8NBN3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM87AQ8NBN3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM87AQ8NBN3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms