Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZIC4Q8N9L1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZIC4Q8N9L1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms