Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MSL3Q8N5Y2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSL3Q8N5Y2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MSL3Q8N5Y2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms