Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RPAP2Q8IXW5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
RPAP2Q8IXW5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
RPAP2Q8IXW5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RPAP2Q8IXW5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RPAP2Q8IXW5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RPAP2Q8IXW5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RPAP2Q8IXW5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RPAP2Q8IXW5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RPAP2Q8IXW5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RPAP2Q8IXW5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RPAP2Q8IXW5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
RPAP2Q8IXW5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RPAP2Q8IXW5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RPAP2Q8IXW5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RPAP2Q8IXW5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RPAP2Q8IXW5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RPAP2Q8IXW5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RPAP2Q8IXW5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RPAP2Q8IXW5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RPAP2Q8IXW5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RPAP2Q8IXW5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RPAP2Q8IXW5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RPAP2Q8IXW5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
RPAP2Q8IXW5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RPAP2Q8IXW5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RPAP2Q8IXW5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RPAP2Q8IXW5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RPAP2Q8IXW5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RPAP2Q8IXW5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RPAP2Q8IXW5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
RPAP2Q8IXW5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RPAP2Q8IXW5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RPAP2Q8IXW5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RPAP2Q8IXW5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.7 ms