Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHERPQ8IWX8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHERPQ8IWX8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms