Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VSTM4Q8IW00 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VSTM4Q8IW00 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VSTM4Q8IW00 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VSTM4Q8IW00 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VSTM4Q8IW00 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VSTM4Q8IW00 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VSTM4Q8IW00 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VSTM4Q8IW00 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VSTM4Q8IW00 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VSTM4Q8IW00 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VSTM4Q8IW00 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VSTM4Q8IW00 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VSTM4Q8IW00 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VSTM4Q8IW00 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VSTM4Q8IW00 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VSTM4Q8IW00 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VSTM4Q8IW00 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VSTM4Q8IW00 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VSTM4Q8IW00 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VSTM4Q8IW00 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VSTM4Q8IW00 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VSTM4Q8IW00 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
VSTM4Q8IW00 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VSTM4Q8IW00 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VSTM4Q8IW00 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VSTM4Q8IW00 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VSTM4Q8IW00 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VSTM4Q8IW00 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VSTM4Q8IW00 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VSTM4Q8IW00 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VSTM4Q8IW00 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
VSTM4Q8IW00 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VSTM4Q8IW00 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 236.1 ms