Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV50

LYSMD2, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD2Q8IV50 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYSMD2Q8IV50 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYSMD2Q8IV50 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYSMD2Q8IV50 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYSMD2Q8IV50 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYSMD2Q8IV50 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYSMD2Q8IV50 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYSMD2Q8IV50 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYSMD2Q8IV50 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LYSMD2Q8IV50 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYSMD2Q8IV50 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYSMD2Q8IV50 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LYSMD2Q8IV50 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms