Protein–RNA interactions for Protein: Q86XE0

SNX32, Sorting nexin-32, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX32Q86XE0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX32Q86XE0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms