Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
SKAP1Q86WV1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SKAP1Q86WV1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SKAP1Q86WV1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SKAP1Q86WV1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms