Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC84Q86UT8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC84Q86UT8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC84Q86UT8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC84Q86UT8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC84Q86UT8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC84Q86UT8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC84Q86UT8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC84Q86UT8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC84Q86UT8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC84Q86UT8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC84Q86UT8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC84Q86UT8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC84Q86UT8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC84Q86UT8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC84Q86UT8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC84Q86UT8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC84Q86UT8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC84Q86UT8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC84Q86UT8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC84Q86UT8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC84Q86UT8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC84Q86UT8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC84Q86UT8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC84Q86UT8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC84Q86UT8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC84Q86UT8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC84Q86UT8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC84Q86UT8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC84Q86UT8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC84Q86UT8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC84Q86UT8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC84Q86UT8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC84Q86UT8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC84Q86UT8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC84Q86UT8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC84Q86UT8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC84Q86UT8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC84Q86UT8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC84Q86UT8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC84Q86UT8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC84Q86UT8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC84Q86UT8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC84Q86UT8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC84Q86UT8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC84Q86UT8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC84Q86UT8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms