Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00299Q6ZSB3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms