Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CCDC141Q6ZP82 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CCDC141Q6ZP82 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CCDC141Q6ZP82 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC141Q6ZP82 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC141Q6ZP82 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC141Q6ZP82 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CCDC141Q6ZP82 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC141Q6ZP82 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC141Q6ZP82 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC141Q6ZP82 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC141Q6ZP82 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC141Q6ZP82 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CCDC141Q6ZP82 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CCDC141Q6ZP82 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CCDC141Q6ZP82 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CCDC141Q6ZP82 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CCDC141Q6ZP82 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CCDC141Q6ZP82 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CCDC141Q6ZP82 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CCDC141Q6ZP82 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC141Q6ZP82 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC141Q6ZP82 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC141Q6ZP82 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC141Q6ZP82 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CCDC141Q6ZP82 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CCDC141Q6ZP82 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CCDC141Q6ZP82 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CCDC141Q6ZP82 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CCDC141Q6ZP82 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CCDC141Q6ZP82 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CCDC141Q6ZP82 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CCDC141Q6ZP82 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CCDC141Q6ZP82 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CCDC141Q6ZP82 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC141Q6ZP82 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC141Q6ZP82 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC141Q6ZP82 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC141Q6ZP82 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC141Q6ZP82 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC141Q6ZP82 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC141Q6ZP82 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC141Q6ZP82 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CCDC141Q6ZP82 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CCDC141Q6ZP82 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CCDC141Q6ZP82 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CCDC141Q6ZP82 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CCDC141Q6ZP82 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
CCDC141Q6ZP82 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.54
CCDC141Q6ZP82 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC141Q6ZP82 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC141Q6ZP82 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC141Q6ZP82 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC141Q6ZP82 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CCDC141Q6ZP82 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CCDC141Q6ZP82 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CCDC141Q6ZP82 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CCDC141Q6ZP82 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC141Q6ZP82 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC141Q6ZP82 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC141Q6ZP82 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC141Q6ZP82 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC141Q6ZP82 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC141Q6ZP82 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC141Q6ZP82 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC141Q6ZP82 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.13■■■■□ 3.54
CCDC141Q6ZP82 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
CCDC141Q6ZP82 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC141Q6ZP82 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC141Q6ZP82 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC141Q6ZP82 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CCDC141Q6ZP82 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CCDC141Q6ZP82 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC141Q6ZP82 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC141Q6ZP82 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC141Q6ZP82 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms