Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMP0

THSD4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD4Q6ZMP0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
THSD4Q6ZMP0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD4Q6ZMP0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD4Q6ZMP0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD4Q6ZMP0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD4Q6ZMP0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD4Q6ZMP0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD4Q6ZMP0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THSD4Q6ZMP0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22■■□□□ 1.11
THSD4Q6ZMP0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THSD4Q6ZMP0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
THSD4Q6ZMP0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
THSD4Q6ZMP0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THSD4Q6ZMP0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms