Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCBE1Q6UXH8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCBE1Q6UXH8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCBE1Q6UXH8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms