Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM220Q6QAJ8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM220Q6QAJ8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM220Q6QAJ8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms