Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S1

DENND1B, DENN domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1BQ6P3S1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND1BQ6P3S1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND1BQ6P3S1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND1BQ6P3S1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND1BQ6P3S1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND1BQ6P3S1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND1BQ6P3S1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DENND1BQ6P3S1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DENND1BQ6P3S1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms