Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF20Q5VTR2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF20Q5VTR2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF20Q5VTR2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF20Q5VTR2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF20Q5VTR2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF20Q5VTR2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF20Q5VTR2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF20Q5VTR2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF20Q5VTR2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF20Q5VTR2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF20Q5VTR2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF20Q5VTR2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF20Q5VTR2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF20Q5VTR2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF20Q5VTR2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF20Q5VTR2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF20Q5VTR2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF20Q5VTR2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF20Q5VTR2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF20Q5VTR2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF20Q5VTR2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF20Q5VTR2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF20Q5VTR2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF20Q5VTR2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF20Q5VTR2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF20Q5VTR2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF20Q5VTR2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF20Q5VTR2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF20Q5VTR2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF20Q5VTR2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms