Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3CQ5T2N8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATAD3CQ5T2N8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3CQ5T2N8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms