Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL8

PRAMEF19, PRAME family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF19Q5SWL8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRAMEF19Q5SWL8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF19Q5SWL8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRAMEF19Q5SWL8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRAMEF19Q5SWL8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRAMEF19Q5SWL8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PRAMEF19Q5SWL8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PRAMEF19Q5SWL8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRAMEF19Q5SWL8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRAMEF19Q5SWL8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEF19Q5SWL8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEF19Q5SWL8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEF19Q5SWL8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF19Q5SWL8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF19Q5SWL8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF19Q5SWL8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF19Q5SWL8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF19Q5SWL8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF19Q5SWL8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF19Q5SWL8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF19Q5SWL8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF19Q5SWL8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF19Q5SWL8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF19Q5SWL8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF19Q5SWL8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRAMEF19Q5SWL8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRAMEF19Q5SWL8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRAMEF19Q5SWL8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRAMEF19Q5SWL8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRAMEF19Q5SWL8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF19Q5SWL8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF19Q5SWL8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF19Q5SWL8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF19Q5SWL8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF19Q5SWL8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF19Q5SWL8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF19Q5SWL8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF19Q5SWL8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF19Q5SWL8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF19Q5SWL8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF19Q5SWL8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF19Q5SWL8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms