Protein–RNA interactions for Protein: Q5ST30

VARS2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS2Q5ST30 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VARS2Q5ST30 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VARS2Q5ST30 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
VARS2Q5ST30 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VARS2Q5ST30 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VARS2Q5ST30 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VARS2Q5ST30 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VARS2Q5ST30 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VARS2Q5ST30 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VARS2Q5ST30 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VARS2Q5ST30 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VARS2Q5ST30 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VARS2Q5ST30 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VARS2Q5ST30 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
VARS2Q5ST30 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VARS2Q5ST30 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VARS2Q5ST30 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VARS2Q5ST30 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VARS2Q5ST30 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VARS2Q5ST30 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VARS2Q5ST30 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
VARS2Q5ST30 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VARS2Q5ST30 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VARS2Q5ST30 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VARS2Q5ST30 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VARS2Q5ST30 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VARS2Q5ST30 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VARS2Q5ST30 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VARS2Q5ST30 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VARS2Q5ST30 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VARS2Q5ST30 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VARS2Q5ST30 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VARS2Q5ST30 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VARS2Q5ST30 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VARS2Q5ST30 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VARS2Q5ST30 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VARS2Q5ST30 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VARS2Q5ST30 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms