Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKV6

EXOSC6, Exosome complex component MTR3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC6Q5RKV6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC6Q5RKV6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC6Q5RKV6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC6Q5RKV6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.3 ms