Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC158Q5M9N0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC158Q5M9N0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC158Q5M9N0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms