Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C3orf38Q5JPI3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C3orf38Q5JPI3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms