Protein–RNA interactions for Protein: Q3KR37

GRAMD1B, GRAM domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1BQ3KR37 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRAMD1BQ3KR37 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD1BQ3KR37 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRAMD1BQ3KR37 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1BQ3KR37 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1BQ3KR37 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1BQ3KR37 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1BQ3KR37 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1BQ3KR37 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1BQ3KR37 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1BQ3KR37 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1BQ3KR37 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1BQ3KR37 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1BQ3KR37 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms