Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP5B1Q2VPB7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP5B1Q2VPB7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP5B1Q2VPB7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP5B1Q2VPB7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP5B1Q2VPB7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP5B1Q2VPB7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP5B1Q2VPB7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP5B1Q2VPB7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AP5B1Q2VPB7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP5B1Q2VPB7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP5B1Q2VPB7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms