Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NTRK2Q16620 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK2Q16620 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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