Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
E2F4Q16254 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
E2F4Q16254 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
E2F4Q16254 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
E2F4Q16254 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
E2F4Q16254 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
E2F4Q16254 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
E2F4Q16254 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
E2F4Q16254 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
E2F4Q16254 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
E2F4Q16254 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
E2F4Q16254 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
E2F4Q16254 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
E2F4Q16254 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.56■■■□□ 2
E2F4Q16254 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
E2F4Q16254 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
E2F4Q16254 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
E2F4Q16254 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
E2F4Q16254 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
E2F4Q16254 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
E2F4Q16254 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
E2F4Q16254 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.54■■■□□ 2
E2F4Q16254 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
E2F4Q16254 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
E2F4Q16254 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
E2F4Q16254 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
E2F4Q16254 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
E2F4Q16254 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
E2F4Q16254 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
E2F4Q16254 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
E2F4Q16254 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
E2F4Q16254 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
E2F4Q16254 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
E2F4Q16254 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.1 ms