Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USF2Q15853 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USF2Q15853 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USF2Q15853 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USF2Q15853 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USF2Q15853 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USF2Q15853 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USF2Q15853 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USF2Q15853 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USF2Q15853 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USF2Q15853 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USF2Q15853 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USF2Q15853 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USF2Q15853 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USF2Q15853 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USF2Q15853 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USF2Q15853 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USF2Q15853 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USF2Q15853 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USF2Q15853 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USF2Q15853 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
USF2Q15853 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USF2Q15853 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USF2Q15853 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USF2Q15853 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USF2Q15853 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USF2Q15853 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USF2Q15853 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USF2Q15853 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USF2Q15853 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USF2Q15853 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
USF2Q15853 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USF2Q15853 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USF2Q15853 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USF2Q15853 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USF2Q15853 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USF2Q15853 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USF2Q15853 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USF2Q15853 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USF2Q15853 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USF2Q15853 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USF2Q15853 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USF2Q15853 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USF2Q15853 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USF2Q15853 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
USF2Q15853 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
USF2Q15853 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USF2Q15853 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USF2Q15853 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USF2Q15853 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USF2Q15853 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USF2Q15853 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
USF2Q15853 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USF2Q15853 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USF2Q15853 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
USF2Q15853 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
USF2Q15853 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USF2Q15853 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USF2Q15853 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USF2Q15853 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
USF2Q15853 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
USF2Q15853 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
USF2Q15853 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
USF2Q15853 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
USF2Q15853 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
USF2Q15853 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
USF2Q15853 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
USF2Q15853 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
USF2Q15853 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
USF2Q15853 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
USF2Q15853 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
USF2Q15853 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
USF2Q15853 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
USF2Q15853 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
USF2Q15853 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USF2Q15853 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
USF2Q15853 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
USF2Q15853 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USF2Q15853 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USF2Q15853 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USF2Q15853 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
USF2Q15853 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USF2Q15853 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USF2Q15853 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USF2Q15853 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USF2Q15853 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USF2Q15853 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USF2Q15853 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USF2Q15853 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USF2Q15853 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USF2Q15853 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USF2Q15853 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USF2Q15853 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USF2Q15853 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USF2Q15853 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USF2Q15853 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USF2Q15853 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USF2Q15853 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USF2Q15853 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USF2Q15853 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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