Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SF1Q15637 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SF1Q15637 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SF1Q15637 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SF1Q15637 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SF1Q15637 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SF1Q15637 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SF1Q15637 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SF1Q15637 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SF1Q15637 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SF1Q15637 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SF1Q15637 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SF1Q15637 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SF1Q15637 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SF1Q15637 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SF1Q15637 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SF1Q15637 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SF1Q15637 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SF1Q15637 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SF1Q15637 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SF1Q15637 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SF1Q15637 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SF1Q15637 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SF1Q15637 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SF1Q15637 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SF1Q15637 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SF1Q15637 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SF1Q15637 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SF1Q15637 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SF1Q15637 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SF1Q15637 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SF1Q15637 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SF1Q15637 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SF1Q15637 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SF1Q15637 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SF1Q15637 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SF1Q15637 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SF1Q15637 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SF1Q15637 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SF1Q15637 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SF1Q15637 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SF1Q15637 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SF1Q15637 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SF1Q15637 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SF1Q15637 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SF1Q15637 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SF1Q15637 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SF1Q15637 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SF1Q15637 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SF1Q15637 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SF1Q15637 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SF1Q15637 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SF1Q15637 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SF1Q15637 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SF1Q15637 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SF1Q15637 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SF1Q15637 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SF1Q15637 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SF1Q15637 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SF1Q15637 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SF1Q15637 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SF1Q15637 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SF1Q15637 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SF1Q15637 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SF1Q15637 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SF1Q15637 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SF1Q15637 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SF1Q15637 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SF1Q15637 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SF1Q15637 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SF1Q15637 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SF1Q15637 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SF1Q15637 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SF1Q15637 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SF1Q15637 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SF1Q15637 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SF1Q15637 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SF1Q15637 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SF1Q15637 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SF1Q15637 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SF1Q15637 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SF1Q15637 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SF1Q15637 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SF1Q15637 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SF1Q15637 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SF1Q15637 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SF1Q15637 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SF1Q15637 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SF1Q15637 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SF1Q15637 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SF1Q15637 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SF1Q15637 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SF1Q15637 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SF1Q15637 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SF1Q15637 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SF1Q15637 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SF1Q15637 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SF1Q15637 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SF1Q15637 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SF1Q15637 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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