Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NECTIN1Q15223 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NECTIN1Q15223 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NECTIN1Q15223 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NECTIN1Q15223 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NECTIN1Q15223 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NECTIN1Q15223 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NECTIN1Q15223 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NECTIN1Q15223 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NECTIN1Q15223 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NECTIN1Q15223 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NECTIN1Q15223 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NECTIN1Q15223 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NECTIN1Q15223 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NECTIN1Q15223 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NECTIN1Q15223 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
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