Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL3Q13618 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL3Q13618 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms