Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRF5Q13568 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRF5Q13568 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRF5Q13568 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRF5Q13568 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRF5Q13568 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRF5Q13568 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRF5Q13568 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
IRF5Q13568 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
IRF5Q13568 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRF5Q13568 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRF5Q13568 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRF5Q13568 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRF5Q13568 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRF5Q13568 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRF5Q13568 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRF5Q13568 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRF5Q13568 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRF5Q13568 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRF5Q13568 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRF5Q13568 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRF5Q13568 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRF5Q13568 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRF5Q13568 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRF5Q13568 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRF5Q13568 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRF5Q13568 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRF5Q13568 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRF5Q13568 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
IRF5Q13568 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRF5Q13568 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRF5Q13568 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRF5Q13568 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRF5Q13568 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRF5Q13568 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRF5Q13568 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRF5Q13568 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRF5Q13568 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
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