Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATMQ13315 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATMQ13315 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATMQ13315 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATMQ13315 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATMQ13315 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATMQ13315 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATMQ13315 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATMQ13315 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATMQ13315 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATMQ13315 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATMQ13315 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATMQ13315 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATMQ13315 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATMQ13315 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATMQ13315 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATMQ13315 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATMQ13315 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATMQ13315 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATMQ13315 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATMQ13315 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATMQ13315 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATMQ13315 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATMQ13315 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATMQ13315 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMQ13315 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMQ13315 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMQ13315 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMQ13315 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMQ13315 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATMQ13315 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATMQ13315 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATMQ13315 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATMQ13315 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATMQ13315 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATMQ13315 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATMQ13315 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATMQ13315 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATMQ13315 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATMQ13315 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATMQ13315 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATMQ13315 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATMQ13315 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATMQ13315 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMQ13315 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMQ13315 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMQ13315 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMQ13315 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMQ13315 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMQ13315 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATMQ13315 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATMQ13315 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATMQ13315 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATMQ13315 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATMQ13315 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATMQ13315 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATMQ13315 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATMQ13315 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATMQ13315 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATMQ13315 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATMQ13315 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATMQ13315 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMQ13315 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMQ13315 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMQ13315 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMQ13315 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMQ13315 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMQ13315 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMQ13315 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMQ13315 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATMQ13315 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATMQ13315 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATMQ13315 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATMQ13315 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATMQ13315 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATMQ13315 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATMQ13315 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATMQ13315 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATMQ13315 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATMQ13315 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATMQ13315 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATMQ13315 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATMQ13315 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATMQ13315 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATMQ13315 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATMQ13315 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATMQ13315 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATMQ13315 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATMQ13315 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATMQ13315 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATMQ13315 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATMQ13315 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATMQ13315 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATMQ13315 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATMQ13315 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATMQ13315 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATMQ13315 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATMQ13315 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATMQ13315 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATMQ13315 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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