Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRSF5Q13243 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRSF5Q13243 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SRSF5Q13243 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRSF5Q13243 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
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