Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR1H3Q13133 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR1H3Q13133 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms