Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SLFN5Q08AF3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SLFN5Q08AF3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SLFN5Q08AF3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SLFN5Q08AF3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SLFN5Q08AF3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SLFN5Q08AF3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
SLFN5Q08AF3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
SLFN5Q08AF3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SLFN5Q08AF3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SLFN5Q08AF3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SLFN5Q08AF3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms