Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNP2Q05952 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms