Protein–RNA interactions for Protein: Q05066

SRY, Sex-determining region Y protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRYQ05066 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRYQ05066 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRYQ05066 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRYQ05066 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRYQ05066 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRYQ05066 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRYQ05066 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRYQ05066 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRYQ05066 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRYQ05066 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRYQ05066 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRYQ05066 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRYQ05066 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRYQ05066 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRYQ05066 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRYQ05066 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRYQ05066 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRYQ05066 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRYQ05066 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRYQ05066 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRYQ05066 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRYQ05066 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRYQ05066 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRYQ05066 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRYQ05066 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRYQ05066 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRYQ05066 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRYQ05066 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRYQ05066 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRYQ05066 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRYQ05066 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRYQ05066 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRYQ05066 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRYQ05066 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRYQ05066 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRYQ05066 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRYQ05066 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRYQ05066 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRYQ05066 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRYQ05066 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRYQ05066 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRYQ05066 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRYQ05066 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRYQ05066 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRYQ05066 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRYQ05066 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRYQ05066 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRYQ05066 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRYQ05066 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRYQ05066 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRYQ05066 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRYQ05066 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRYQ05066 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRYQ05066 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRYQ05066 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRYQ05066 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRYQ05066 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRYQ05066 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRYQ05066 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRYQ05066 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRYQ05066 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRYQ05066 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SRYQ05066 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRYQ05066 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRYQ05066 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRYQ05066 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRYQ05066 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRYQ05066 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRYQ05066 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRYQ05066 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SRYQ05066 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRYQ05066 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRYQ05066 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRYQ05066 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRYQ05066 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRYQ05066 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRYQ05066 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SRYQ05066 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRYQ05066 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRYQ05066 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRYQ05066 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRYQ05066 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRYQ05066 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRYQ05066 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRYQ05066 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRYQ05066 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRYQ05066 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRYQ05066 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRYQ05066 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRYQ05066 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRYQ05066 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRYQ05066 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRYQ05066 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRYQ05066 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRYQ05066 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRYQ05066 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRYQ05066 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRYQ05066 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRYQ05066 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRYQ05066 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms