Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TLE4Q04727 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms