Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
POU5F1Q01860 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POU5F1Q01860 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POU5F1Q01860 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POU5F1Q01860 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POU5F1Q01860 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POU5F1Q01860 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POU5F1Q01860 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POU5F1Q01860 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POU5F1Q01860 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POU5F1Q01860 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
POU5F1Q01860 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POU5F1Q01860 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POU5F1Q01860 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POU5F1Q01860 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms